El Comisionado para el Mercado de Tabacos, organismo autónomo dependiente del Ministerio de Hacienda a través de la Subsecretaría, se estructura en los siguientes órganos y unidades:
- Presidente: Luis Gavira Caballero
- Vicepresidente: Alberto Salcines Sáez
- Área de Coordinación Jurídica y Control del Mercado: Borja García Ramos
- Área de Gestión del Mercado Minorista: Ignacio Díaz Sanz
- Área de Inspección del Mercado: Manuel Cuevas Sedano
- Área de Tecnologías de la Información y de las Comunicaciones: Rafael Santos García
- Área Económica-Financiera, de Recursos Humanos y Servicios Generales: Laura Sancho Villota
El Comité Consultivo del Comisionado para el Mercado de Tabacos tiene funciones de asistencia y asesoramiento en todas las materias relativas al mercado de tabacos, a su organización y funcionamiento, y está compuesto por representantes de los operadores de cada una de las fases del proceso de producción y distribución de productos del tabaco, los consumidores y las Administraciones aduanera, tributaria, comercial, agroalimentaria y sanitaria, según determina el Estatuto del Comisionado.