El Comisionado para el Mercado de Tabacos, organismo autónomo dependiente del Ministerio de Hacienda y Función Pública a través de la Subsecretaría, se estructura en los siguientes órganos y unidades:
El Comité Consultivo del Comisionado para el Mercado de Tabacos tiene funciones de asistencia y asesoramiento en todas las materias relativas al mercado de tabacos, a su organización y funcionamiento, y está compuesto por representantes de los operadores de cada una de las fases del proceso de producción y distribución de productos del tabaco, los consumidores y las Administraciones aduanera, tributaria, comercial, agroalimentaria y sanitaria, según determina el Estatuto del Comisionado.